Базовые пары 3b ДНК — обработка со скоростью жизни

Благодаря возможности обработки петабайт данных ДНК, глобальный лидер в области геномики помогает ускорить поиск лекарств и способов лечения самых коварных болезней человека.

Логотип HudsonAlpha

Преобразование операций для ускорения исследований

Институту HudsonAlpha требуются гибкие высокопроизводительные системы и решения для подключения, способные поддержать интенсивные исследования, совместную работу и аналитические процессы, без которых современные научные открытия просто невозможны.

Воспроизвести видео
2:59

Некоммерческий центр геномных исследований HudsonAlpha Institute for Biotechnology начал свою работу в 2008 году в г. Хантсвилл, штат Алабама. Институт, в котором 200 научных сотрудников работают над некоммерческими проектами и 600 специалистов — в коммерческом секторе, занимает площадь 61,5 га. Он собрал исследователей и ученых из самых разных научных дисциплин. Всех их объединяет интерес к геномике, обещающей беспрецедентную возможность определения причин и средств лечения многих болезней. Исследователи института также заинтересованы в тесном сотрудничестве, которое позволит генерировать свежие идеи на основе разных научных дисциплин, а также постичь тенденции в состоянии здоровья и самочувствия пациентов на более глобальном уровне.

Современное биотехническое оборудование, в частности геномные секвенаторы, генерируют громадные объемы данных по ДНК. HudsonAlpha нуждается в надежной инфраструктуре, достаточно мощной, чтобы удовлетворять потребности исследователей, но легко управляемой и экономичной.

№1

Рейтинг по размеру среди институтов США, специализирующийся на секвенировании по методу De-novo

Более 200

исследователей

№5

Рейтинг по размеру среди институтов США, специализирующихся на секвенировании целого генома
  • "В геномике масштабы и темпы роста объемов данных меняются настолько быстро, что нам потребовались новые, более эффективные решения, для инфраструктуры вычислений, сетей и хранения информации".

    Пейтон МакНулли, директор по ИТ, HudsonAlpha Institute for Biotechnology

Мощная технология в руках ученых

В HudsonAlpha была сформирована концепция конвергентной инфраструктуры, включающей вычислительные, сетевые ресурсы и ресурсы для хранения данных.

В HudsonAlpha используется компонуемая платформа HPE Synergy, образующая вычислительный ресурс, достаточно мощный для поддержки задач, связанных с обработкой больших объемов данных, которые решают исследователи института, и одновременно оптимизирующий управление системами. Единый прикладной интерфейс (API) платформы позволяет пользователям программировать инфраструктуру как код, автоматически охватывающую множество центров обработки данных. Эта платформа поддерживает необходимые HudsonAlpha приложения, такие как HPE Vertica Advanced, с помощью которых исследователи определяют закономерности в динамике огромных пулов данных ДНК, генерируемых геномными секвенаторами института.

3 млрд.

Число базовых пар ДНК в одном геноме человека

250 Пбайт

Объем геномных данных, генерируемых ежегодно
  • "Темпы наших исследований сразу же выросли. Теперь мы можем объединить все потребности наших 34 компаний и 200 исследователей и удовлетворять их в комплексе, используя наши ресурсы с максимальной эффективностью".

    Джим Хадсон, соучредитель и председатель, HudsonAlpha Institute for Biotechnology

Ускоренный поиск способов лечения

HudsonAlpha помогает достичь великой цели геномики — найти лекарство от рака и других болезней.

Благодаря технологии HPE Synergy институт HudsonAlpha может предложить своим научным специалистам огромные вычислительные мощности. Например, в некоторых случаях время подготовки и выделения ресурсов сократилось с четырех дней до двух часов. Это помогает ученым института оперативно проверять идеи исследователей и сокращает сроки, необходимые для вынесения заключений и получения результатов диагностики.

Данное решение также позволило увеличить емкость хранения и сократить затраты на каждый терабайт. Это важнейший аспект при выборе платформы для хранения данных ДНК миллионов человек и поддержки исследований, в которых ежемесячно задействовано более петабайта данных.

800

Число клиентов во всем мире, пользующихся геномными данными института HudsonAlpha

3000

Число геномов пациентов, которые были секвенированы в 2016 году в одной из семейных клиник при поддержке HudsonAlpha с целью улучшения диагностики заболеваний
  • "Не ограничивайте себя жесткими рамками или стандартными процедурами. У вас должна быть возможность отказаться от процесса или решения в следующий месяц или квартал, если этот процесс или решение не работает".

    Пейтон МакНулли, директор по ИТ, HudsonAlpha Institute for Biotechnology

Описание решения

Вот технологии, которые использует институт HudsonAlpha для предоставления полученных данных ДНК и ускорения геномных исследований.


В HudsonAlpha рабочие задачи производственного уровня реализуются на базе компонуемой инфраструктуры HPE Synergy с тремя вычислительными модулями Synergy, модулем хранения HPE Synergy D3940 Storage и тремя системами HPE SimpliVity 380, управляемыми с помощью HPE OneView. Чтобы проверить простоту установки решения, в HudsonAlpha еще до прибытия специалистов поддержки HPE была быстро проведена установка и настройка оборудования.