Coppie di basi del DNA 3b, elaborate alla velocità della vita

Trasforma le operazioni per accelerare la ricerca

HudsonAlpha necessita di sistemi e soluzioni di connettività flessibili a elevate prestazioni per supportare le intense attività di ricerca, collaborazione e analisi che rendono possibili l’innovazione scientifica.

L’HudsonAlpha Institute for Biotechnology è un centro di ricerca sul genoma senza scopo di lucro fondato a Huntsville, in Alabama, nel 2008. Con 200 scienziati che lavorano nella sezione no-profit e 600 in quella a scopo di lucro, il campus di quasi 62 ettari dell’istituto ospita ricercatori e scienziati di diverse discipline. L’interesse comune è la scienza della genomica, che promette una comprensione senza precedenti delle cause e delle cure delle patologie. I ricercatori dell’istituto sono anche interessati a collaborare per generare nuove informazioni interdisciplinari e approfondire la comprensione delle tendenze in campo sanitario e dei pool di pazienti a livello globale.

Le attrezzature odierne per la biotecnologia, in particolare i sequenziatori di genoma, generano enormi quantità di dati di ricerca sul DNA. L’HudsonAlpha necessita di un’infrastruttura robusta, dotata della potenza sufficiente a soddisfare le esigenze dei ricercatori, ma abbastanza gestibile da operare a costi contenuti.

Tecnologia potente a disposizione degli scienziati

L’HudsonAlpha puntava a un’infrastruttura di elaborazione, rete e storage convergente.

L’HudsonAlpha usa la piattaforma componibile HPE Synergy per realizzare una risorsa di elaborazione abbastanza potente da supportare i carichi di lavoro a uso intensivo dei dati dei ricercatori nel campo della genomica, ottimizzando al contempo la gestione dei sistemi. La sua API (Application Program Interface) unica consente agli utenti di programmare l’intera infrastruttura come codice in diversi data center in modo automatizzato. La piattaforma supporta applicazioni, come HPE Vertica Advanced Analytics, che aiutano i ricercatori a identificare tendenze e modelli nelle enormi quantità di dati sul DNA generati dai sequenziatori di genoma.

Accelerare la corsa alle cure

L’HudsonAlpha contribuisce alla realizzazione della promessa della genomica di curare il cancro e altre malattie.

Sfruttando la tecnologia HPE Synergy, l’HudsonAlpha è in grado di ottimizzare l’erogazione della potenza di elaborazione necessaria agli scienziati dell’istituto. Ad esempio, in alcuni casi i tempi di riprovisioning delle risorse sono stati ridotti da quattro giorni a due ore: questo consente agli scienziati di reagire rapidamente mentre perseguono le idee di ricerca e, potenzialmente, di ridurre i tempi di conclusione degli studi e di presentazione dei risultati diagnostici.

La soluzione ha incrementato la capacità di storage e ridotto il costo per terabyte, un requisito fondamentale per una piattaforma che deve ospitare i dati sul DNA di milioni di individui, raggiungendo volumi superiori a un petabyte al mese.