按照生命的速度加工的 3b DNA 碱基对

通过处理多达数万兆字节的 DNA 信息,这家全球基因组领域的佼佼者正在加快寻找治愈人类潜在重大疾病的疗法。

HudsonAlpha 徽标

转变运营方式,加快研究速度

HudsonAlpha 需要灵活、高性能的系统与连接解决方案,以支持对推动科学突破具有决定性意义的密集型研究、协作和分析。

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HudsonAlpha 生物技术研究所于 2008 年创立于美国阿拉巴马州亨茨维尔市,是一家非盈利性基因组研究中心。该研究所拥有 200 名科学家从事非盈利性方面的工作,600 名科学家从事盈利性方面的工作,其 152 英亩的园区是各学科研究人员和科学家的美好家园。他们的共同爱好是基因组科学,该门科学有望在理解疾病的原因和治疗方面取得空前的突破。该研究所的研究人员还热衷于协作,希望形成跨学科的新颖见解,并深入了解全球的健康趋势和患者库。

如今的生物技术设备(尤其是基因组顺序分析仪)生成了大量 DNA 研究数据。HudsonAlpha 需要稳健的基础设施,该设施不仅要拥有足以满足研究人员需求的强大性能,还要拥有足够的可管理性,以便经济高效地运行。

第 1 名

美国 De-novo 测序机构规模排名

200+

研究人员数量

第 5 名

美国全人类基因组测序机构规模排名
  • “在基因组研究领域,数据的规模和增长发展得如此之快,以致于我们不得不针对自身的计算、网络和存储基础设施考虑更加周全的新选项。”

    HudsonAlpha 生物技术研究所首席信息官 Peyton McNully

供科学家使用的强大技术

HudsonAlpha 构想了一套融合式计算、网络和存储基础设施。

HudsonAlpha 正在使用 HPE Synergy 可组合平台构建计算资源,该资源的强大性能将足以支持基因组研究人员的数据密集型工作负荷,同时还可以简化系统管理。其单一的应用编程接口 (API) 使用户能够以自动化的方式为跨多个数据中心的整个基础设施即代码进行编程。该平台支持 HudsonAlpha 可能利用的应用(如 HPE Vertica Advanced Analytics),以帮助研究人员在基因组顺序分析仪生成的庞大 DNA 数据池中识别出趋势和型式。

30 亿

单个人类基因组中的 DNA 碱基对

250 PB

每年产生的基因组数据量
  • “它使速度立刻得到了提升。我们可以将 34 家公司和 200 名研究人员的需求汇集到一起,然后以尽可能高效的方式使用我们资源。”

    HudsonAlpha 生物技术研究所共同创始人兼主席 Jim Hudson

在治疗竞赛中加速前行

HudsonAlpha 正在实现用基因组治愈癌症和其他疾病的重大承诺。

通过 HPE Synergy 技术,HudsonAlpha 可以简化向研究所科学家交付计算能力的过程。例如,在某些案例当中,重新配置资源的时间从四天缩短到了两小时。这将帮助研究所的科学家们在贯彻研究理念时迅速作出反应,并且有可能缩短发表研究结论和诊断结果的时间。

该解决方案提高了存储容量并降低了每百万兆字节的成本,能够实现这些成效的目的在于:该平台必须容纳来自数百万个个人的 DNA 数据,而且每个月的数据量达到了上万兆字节。

800

世界各地通过 HudsonAlpha 基因组数据服务享受服务的客户数量

3,000

2016 年为了改进疾病的诊断在家庭诊所里测序的病人基因组数量(由 HudsonAlpha 提供支持)
  • "不要陷入一成不变的文化或标准的操作程序中。您必须要随机应变,如果某个流程没有效果,您应在下个月或者下个季度取消该流程。"

    HudsonAlpha 生物技术研究所首席信息官 Peyton McNully

解决方案实施方法

以下介绍了 HudsonAlpha 用于共享 DNA 数据和加快基因组研究的技术。


HudsonAlpha 在 HPE Synergy 可组合基础设施上面运行生产级工作负荷,该基础设施包含三个 Synergy 计算模块、一个 HPE Synergy D3940 存储模块和三个 HPE SimpliVity 380 系统,并且配备了用于系统管理的 HPE OneView。为测试安装的简易性,HudsonAlpha 在 HPE 支持团队抵达之前就已迅速安装好该硬件。