3 milliards de paires de bases d’ADN, traitées à la vitesse de la vie

Pour gérer les pétaoctets d’informations ADN, ce leader international en génomique accélère la recherche de remèdes aux maladies les plus insidieuses au monde.

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Transformer les opérations pour accélérer la recherche

HudsonAlpha a besoin de systèmes flexibles, haute performance, et de solutions de connectivité pour prendre en charge la recherche intensive, la collaboration et l’analyse qui sont essentielles pour développer les découvertes scientifiques.

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HudsonAlpha Institute for Biotechnology, un centre de recherche génomique à but non lucratif, a démarré son activité à Huntsville, Alabama en 2008. Avec 200 chercheurs scientifiques travaillant pour une organisation à but non lucratif et 600 autres à but lucratif, le campus de l’institut de 600 m² héberge des chercheurs et des scientifiques issus de nombreuses disciplines. L’intérêt commun est la science des génomes, qui promet une compréhension sans précédent de la cause et du traitement des maladies. Les chercheurs de l’institut souhaitent également mettre en place des collaborations pour générer un nouveau savoir interdisciplinaire et approfondir leur compréhension des tendances en matière de santé et constituer des pools de patients sur une base internationale.

L’équipement biotechnique actuel, et notamment les séquenceurs génomiques, génère des quantités énormes de données de recherche sur l’ADN. HudsonAlpha a besoin d’une infrastructure robuste suffisamment puissante pour répondre aux besoins des chercheurs mais suffisamment gérable pour être rentable.

N° 1

Institution (en taille) pour le séquençage de novo aux États-Unis

200+

Chercheurs

N°5 

Institution (en taille) pour le séquençage génomique humain complet aux États-Unis
  • "Dans la génomique, l’évolution et la croissance des données est si rapide que nous recherchions de nouvelles options, plus avancées, pour notre infrastructure de calcul, réseau et stockage."

    Peyton McNully, DSI, HudsonAlpha Institute for Biotechnology

Technologie puissante dans les mains des scientifiques

HudsonAlpha a rêvé d’une infrastructure convergée de calcul, réseau et stockage.

HudsonAlpha utilise la plateforme composable HPE Synergy pour créer une ressource de calcul suffisamment puissante pour prendre en charge les charges de travail gourmandes en données de ses chercheurs en génomique tout en simplifiant la gestion du système. Son interface de programmation d'applications unique permet aux utilisateurs de programmer l’ensemble de l’infrastructure en tant que code sur plusieurs datacenters de manière automatique. La plateforme prend en charge les applications que HudsonAlpha peut exploiter, telles que HPE Vertica Advanced Analytics, pour aider les chercheurs à identifier les tendances et les modèles des pools énormes de données ADN générées par ses séquenceurs génomiques.

3 milliards

Paires de bases d’ADN dans un seul génome humain

250 Po

De données génomiques produites par an
  • "La vitesse a été immédiatement accrue. Nous pouvons regrouper les besoins de nos 34 entreprises et 200 chercheurs, et utiliser nos ressources de la manière la plus efficace possible."

    Jim Hudson, co-fondateur et président du Conseil d’administration de HudsonAlpha Institute for Biotechnology

Accélérer la course aux traitements

HudsonAlpha aide à tenir la promesse exceptionnelle de la génomique de soigner le cancer et d’autres maladies.

Grâce à la technologie HPE Synergy, HudsonAlpha peut rationaliser la puissance de calcul mise à la disposition des scientifiques de l’institut. Par exemple, le délai de réaprovisionnement des ressources a été réduit de 4 jours à 2 heures dans certains cas. Cela aide les scientifiques de l’institut à être réactifs dans le cadre de leurs idées de recherche, et réduit potentiellement le temps nécessaire pour obtenir des conclusions et des résultats.

La solution a augmenté la capacité de stockage et réduit le coût par téraoctect, un facteur essentiel pour une plateforme qui doit héberger les données ADN de millions d’individus, atteignant des volumes de plus d’un pétaoctet par mois.

800

Clients du monde entier sont servis par les services de données génomiques de HudsonAlpha.

3 000

Génomes de patients seront séquencés dans une clinique familiale, avec l’aide de HudsonAlpha, pour améliorer le diagnostic médical en 2016
  • "Ne tombez pas dans le piège d’une culture rigide ou d’une procédure d’opération standard. Vous devez être flexible pour annuler un processus ou une solution le mois suivant, ou le trimestre suivant si cela ne fonctionne pas."

    Peyton McNully, DSI, HudsonAlpha Institute for Biotechnology

Composition de la solution

Voici les technologies utilisées par HudsonAlpha pour partager les données ADN et accélérer la recherche génomique.


HudsonAlpha exécute des charges de travail de niveau production sur une infrastructure composable HPE Synergy avec trois modules informatiques Synergy, un module de stockage HPE Synergy D3940, et trois systèmes HPE SimpliVity 380, avec HPE OneView pour la gestion des systèmes. Pour tester la facilité d’installation, HudsonAlpha a réussi à configurer rapidement ce matériel avant l’arrivée de l’équipe d’assistance de HPE.